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白肉或黑肉?提供大数据解读感恩节晚餐

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弗吉尼亚理工大学生化专业猫海耶斯,阮公爵和将石头,土耳其已经采取了一个全新的含义。

这三人和他们的普通生物化学同学一样,受到了农业和生命科学学院生物化学系副教授理查德·赫尔姆的质疑,他们考虑了感恩背后的科学。

教授给了他的学生机会,通过分析大型数据集和在实验室花费时间用最先进的仪器深入实验。以HokieBird为灵感,学生们进行了火鸡的蛋白质分析,看腿,腿和胸肉。他们被要求通过分析赋予火鸡其颜色的蛋白质来研究白肉和黑肉之间的差异。 Helm说:“你可以把很多时间花在数据集上。 “你可以得到更多的问题,而不是答案。但这是很多学生都没有挑战的事情。我希望他们能从真正的实验中检验真正的数据,他们在分析的第一步就能看出来。“

学生们研究最重要的蛋白质,探索高质量的蛋白质鉴定。他们还学会了如何确定火鸡样本中的污染物,以了解组织是如何清洁的。为了了解乳房,大腿和腿部组织蛋白之间的数值差异,学生们分析了数千个电子表格 - 这是一项艰巨的任务。然后,他们开发了自己的公式,颜色编码,过滤器和其他方法,使他们能够看到差异并评估统计显着性。来自弗吉尼亚州斯普林菲尔德的小辈斯通说:“我既害怕又激动。 “在盯着我的计算机上的数据至少一个小时后,我只是跳进水里,想出了如何分类。”

Nguyen还使用白板绘制了信息以及维恩图。

土耳其测试人员也能够通过与液相色谱仪耦合的质谱仪获得一些高科技的帮助。这个新获得的仪器能够进行高度复杂的分析,向年轻的研究者展示各种火鸡蛋白的相对丰度。虽然头盔实验室成员操作机器,学生能够学习如何读取仪器提供的数据。机器也帮助他们验证他们的结果。

研究人员发现,参与糖酵解的酶,葡萄糖转化为能量的代谢途径在火鸡大腿和腿部相似,而在乳房中则不相同。乳房中糖酵解蛋白的浓度较高,因为这种肌肉用于鸟类飞行,这是一个严重依赖糖酵解的过程。

大腿和腿肉中含有相对较少的糖酵解蛋白和更多与线粒体相关的蛋白质,因为这些组织接受更高水平的氧气,而且这些肌肉在火鸡站立或移动时更频繁地使用。

虽然他们的重点是在蛋白质,学生还分析了三个火鸡组织中的脂质,发现大腿肉类脂肪氧化比乳房或腿肉快。据Helm称,这可能会推动进一步的火鸡研究,比较冷冻与新鲜,野生与国内,有机与传统等等。

伊利诺伊州普莱恩菲尔德(Plainfield)的一名初中生海耶斯(Hayes)说:“这真是太好玩了。三名学生都知道他们可以克服恐吓的数据集,并将他们的生化知识应用于真实的数据。他们也渴望看到其他的研究可能从他们的工作中得到启发。

来源:VirginiaTech

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